Publications Scientifiques

[ Article ] A simple and efficient genomic DNA extraction protocol for large scale genetic analyses of plant biological systems

Date de soumission: 30-12-2016
Année de Publication: 2015
Entité/Laboratoire Laboratoire des Sciences du Sol (LSS)
Document type : Article
Discipline(s) : Agriculture & Agronomie
Titre A simple and efficient genomic DNA extraction protocol for large scale genetic analyses of plant biological systems
Auteurs CHABI-SIKA KAMIROU [1], KEFELA T. [2], ADOUKONOU AWO SAGBADJA HUBERT [3], AHOTON ESSÈHOU LÉONARD [4], SAIDOU ALIOU [5], BABA-MOUSSA LAMINE SAÏD [6], BAPTISTE L.J. [7], KOTCHONI SIMEON [8], GACHOMO E.W. [9],
Journal: Plant Gene
Catégorie Journal: Internationale
Impact factor: 0
Volume Journal: 1
DOI: 10.1016/j.plgene.2015.03.001
Resume Extraction of high quality genomic DNA fromhigher plants is hindered by the presence of secondary metabolites, which reduce the yield and quality of the DNA. We describe an alternative protocol for genomic DNA extraction from fresh and dry plant leaves that is amenable to PCR-based genetic analysis. Existing methods were either very lengthy, expensive or not suitable for extraction of genomic DNA from dry leaves. Our method used SDS and high salt concentrations to extract DNA and does not require use of hazardous materials or special laboratory equipment. Genomic DNA extracted using our method was used for PCR-based genetic characterization of different varieties of cashew trees, Anacardium occidentale, via SSR markers as well as Zea mays varieties. This protocol improves existing methods in that it has the advantage of being adaptable to studies with a large number of samples and limited resources. The method is rapid, cost efficient and uses non-hazardous reagents. Genomic DNA extracted using this method has sufficient quality for downstream PCR-based genetic analysis.
Mots clés DNA extraction, Dried leaf, Cashew, Maize, PCR, SSR markers
Pages 43 - 45
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